More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0494 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 228 aa  443  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  50.53 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  48.44 
 
 		 197 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  47.37 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  44.5 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.96 
 
 		 200 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.08 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  42.38 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  47.14 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  48.21 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  37.61 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.71 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.73 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  39.87 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  36.02 
 
 		 400 aa  92  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  31 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  21.67 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.52 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  40.71 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.39 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  42.35 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.39 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  34 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  37.4 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.05 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  28.05 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  33.56 
 
 		 423 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  35 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  32.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  28.09 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.15 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  36.08 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  29.61 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1586  hypothetical protein  33.97 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.728643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.32 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1050  hypothetical protein  33.92 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 354 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  32.54 
 
 		 325 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1207  hypothetical protein  33.92 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.71 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  35.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  42.4 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0377  hypothetical protein  33.92 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0037  hypothetical protein  33.92 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 1287 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.26 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.14 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  29.56 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  31.9 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  31.9 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  31.9 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  31.9 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  31.9 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  31.9 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 296 aa  51.6  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1503  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  39.29 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>