More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3590 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  93.28 
 
 		 253 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  78.09 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  79.34 
 
 		 250 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  80.08 
 
 		 250 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  80.08 
 
 		 250 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  77.46 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  42.08 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  44.14 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  37.55 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  39.67 
 
 		 246 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.25 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  38.04 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.6 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  36.77 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  34.47 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.78 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  34.44 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  26.29 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  26.29 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  26.1 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  25.9 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  25.9 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  26.1 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  26.77 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  25.5 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  29.23 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  27.64 
 
 		 575 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  23.94 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  30.62 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  22.86 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.06 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  21.1 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  30.19 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.93 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.92 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.95 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.78 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  25.59 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  28.71 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  29.85 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  23.42 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.01 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  30.47 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  26.11 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  25.21 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  35.83 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  30.43 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  27.1 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.43 
 
 		 541 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.95 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  38.06 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  28.68 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  27.06 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  45.21 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  30.77 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.83 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.27 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  24.08 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>