90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  45.56 
 
 		 246 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  46.56 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.21 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  40.77 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  43.33 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.02 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  37.6 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  45.34 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  37.21 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  39.63 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  36.64 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  35.66 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  38.17 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  37.79 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  37.79 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.31 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  34.54 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  25.83 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.07 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.07 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  24.91 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  25.19 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  25.19 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.26 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  27.86 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  27.85 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  30.15 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 575 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14490  hypothetical protein  39.53 
 
 		 130 aa  52.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.157587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.43 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.85 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  21.38 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  19.64 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  24.51 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  30.15 
 
 		 907 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.85 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  25.14 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.32 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  20.28 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  30 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.79 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.59 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.37 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  30.16 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.08 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.06 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.78 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  33.59 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  33.68 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.75 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  25.86 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  24.19 
 
 		 524 aa  42.7  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.71 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.51 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.78 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.87 
 
 		 238 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2156  methyltransferase type 12  22.5 
 
 		 234 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.29498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03277  16S RNA G1207 methylase RsmC  26.32 
 
 		 385 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 260 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>