164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6845 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  65.92 
 
 		 221 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  64.13 
 
 		 221 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  57.87 
 
 		 223 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  59.83 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  58.18 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  59.19 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  57.92 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  55.2 
 
 		 223 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  47.06 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  32.68 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  35.33 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  30.7 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  33.48 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  33.04 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  32.6 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  32 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  32 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  32 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  31.97 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  29.35 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  29.61 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  32.41 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  31.42 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  28.84 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  29.52 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.11 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  30.73 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  26.58 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  26.51 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  26.99 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  21.2 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.87 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  26.19 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  19.51 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.34 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 363 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  30.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  30.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  19.13 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  25.34 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  20.18 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  21.95 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  24.07 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 348 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  32.69 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  23.46 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  23.53 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  35.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  36.89 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  33.96 
 
 		 352 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  26.17 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  31.65 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 1039 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.04 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.75 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.58 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  36.67 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  20.87 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  20.63 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.59 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  23.67 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  22.81 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  29.1 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  28.95 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  28.95 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  25.58 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  23.28 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  21.54 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  27.94 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.91 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  24.57 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 365 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>