99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0969 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  100 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  63.56 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  59.83 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  59.55 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  57.73 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  55.56 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  56.05 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  55.45 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  51.15 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  45.09 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  34.47 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.07 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  35.11 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  31.77 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  34.67 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  32.11 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  32 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  34.22 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  32.44 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  32.46 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  31.42 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  25.56 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.39 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  32.4 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  23.11 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  23.87 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  28.21 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  25 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  23.39 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.07 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  32.67 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  34.26 
 
 		 352 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  22.43 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  23.32 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  30.67 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  23.3 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  30.08 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  28.7 
 
 		 351 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 348 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 363 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  26.55 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  22.27 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  28.57 
 
 		 351 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  28.57 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  28.5 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  21.97 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  34.91 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  21.97 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  29.66 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 299 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.52 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  23.83 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  21.12 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  26.17 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  23.92 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  23.92 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  23.92 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.99 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  23.92 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  23.92 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.79 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  21.83 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  29.86 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 351 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  20.51 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.11 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  25.23 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.5 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.69 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  32.52 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  28.34 
 
 		 229 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 281 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 252 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  23.4 
 
 		 267 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  34.82 
 
 		 207 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>