73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5571 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  98.31 
 
 		 236 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  90.64 
 
 		 235 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  90.64 
 
 		 235 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  90.64 
 
 		 235 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  89.36 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  86.32 
 
 		 234 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  71.31 
 
 		 237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  70.46 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  70.04 
 
 		 237 aa  314  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  68.78 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  64.22 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  57.64 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  70 
 
 		 152 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  70 
 
 		 152 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.69 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  33.48 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  27.95 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  26.96 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  36.89 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  36.24 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  36.89 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  37.1 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  36.28 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  35.62 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  32.3 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  31.7 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  34.53 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  35.08 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  32.44 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.27 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  22.63 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.61 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  37.74 
 
 		 414 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.03 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  33.94 
 
 		 399 aa  45.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  38.1 
 
 		 407 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 337 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.67 
 
 		 402 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  23.35 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.97 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  30.99 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 390 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 250 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 258 aa  42  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 218 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  34.26 
 
 		 282 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  30.89 
 
 		 395 aa  42  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 190 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 239 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>