28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19651 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  23.59 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  22.98 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  22.12 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  25.52 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  22.63 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  20.99 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  20.99 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  20.99 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  22.56 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  21.13 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  22.63 
 
 
236 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  25.73 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  21.13 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  24.18 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  23.9 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.82 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.13 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  20.53 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
210 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
187 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  23.36 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  25.32 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  24.47 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  24.48 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  24.6 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  25.36 
 
 
295 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>