64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3745 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  98.31 
 
 		 236 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  91.49 
 
 		 235 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  91.49 
 
 		 235 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  91.49 
 
 		 235 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  90.21 
 
 		 266 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  88.03 
 
 		 234 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  72.15 
 
 		 237 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  71.31 
 
 		 237 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  70.89 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  69.62 
 
 		 237 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  63.79 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  57.64 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  71.33 
 
 		 152 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  71.33 
 
 		 152 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  33.93 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.26 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  27.95 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  27.83 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  36.4 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  34.4 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  36.44 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  35.53 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  36.61 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  36.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  36.69 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  35.5 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  34.08 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  35.08 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  31.14 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  32.89 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.8 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  22.63 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.81 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  37.74 
 
 		 414 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.61 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  34.38 
 
 		 407 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  30 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  33.94 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 310 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.14 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 190 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  23.35 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  31.3 
 
 		 268 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>