101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4362 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  100 
 
 
240 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  47.06 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  45.7 
 
 
221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  45.13 
 
 
232 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  45.09 
 
 
232 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  45.29 
 
 
221 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  44.39 
 
 
224 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  39.91 
 
 
223 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  41.7 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  37.38 
 
 
236 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  40.65 
 
 
223 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  36.46 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  32.74 
 
 
237 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  32.3 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  31.51 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.96 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.19 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
228 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  29.06 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  35.68 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  30.41 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  27.81 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  35.76 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  35.76 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  34.51 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  27.49 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.37 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  24.54 
 
 
226 aa  58.9  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  27.4 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  23.21 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  28.87 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  26.67 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  22.56 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  27.41 
 
 
289 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  27.42 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
240 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  20.98 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  25.55 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  24.19 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  26.28 
 
 
279 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  20.92 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  21.36 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  24.07 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  24.07 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  24.07 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  24.07 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  24.07 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  23.61 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  23.61 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.46 
 
 
395 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.95 
 
 
258 aa  45.1  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  32 
 
 
399 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.21 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  22.33 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  24.28 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
337 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  22.33 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.17 
 
 
335 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.34 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.8 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  26.36 
 
 
363 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  21.47 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  21.65 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  22.33 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
225 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
212 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  21.82 
 
 
243 aa  42  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
229 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  32 
 
 
403 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  30.39 
 
 
181 aa  41.6  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  20.93 
 
 
267 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  20.93 
 
 
267 aa  42  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  20.93 
 
 
267 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>