More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2412 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 240 aa  500  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  61.54 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  54.94 
 
 		 235 aa  274  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  54.04 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  27.71 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.55 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  25.7 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.64 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  29.35 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  27.32 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  26.03 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.2 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  23.04 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.37 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.07 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  23.53 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  27.27 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  24.74 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  26.26 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  35.54 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.35 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  25.5 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  27.88 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  25.5 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  28.65 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.78 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.38 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.67 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  30.63 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.66 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  27.98 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  31.93 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.02 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  28 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  24.88 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 411 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.48 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.24 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  24.5 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.58 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  23.5 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  28.91 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.68 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  32.17 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.72 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.56 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  34.11 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  27.12 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  24.31 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  24.31 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  25.54 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.67 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  26.26 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  26.26 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  31.67 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0047  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.601084 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  25.6 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>