232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2028 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  100 
 
 		 243 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  86.01 
 
 		 243 aa  441  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  80.25 
 
 		 243 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  78.6 
 
 		 243 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  75.72 
 
 		 243 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  75.72 
 
 		 243 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  75.72 
 
 		 243 aa  394  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  75.72 
 
 		 243 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  74.07 
 
 		 243 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  75.72 
 
 		 243 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  74.07 
 
 		 243 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  74.49 
 
 		 243 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  74.07 
 
 		 252 aa  391  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  72.02 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  70.78 
 
 		 244 aa  367  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  66.26 
 
 		 243 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  63.49 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  63.07 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  62.76 
 
 		 246 aa  325  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  61 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  61 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  61 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  61 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  61 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  61 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  61 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  60.58 
 
 		 247 aa  317  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  60.58 
 
 		 247 aa  317  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  60.58 
 
 		 247 aa  317  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  60.58 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  60.58 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  60.58 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  60.17 
 
 		 247 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  60.17 
 
 		 247 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  61.34 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  60.67 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  60.67 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  60.67 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  59.83 
 
 		 247 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  59.83 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  60 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  59.34 
 
 		 247 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  59.17 
 
 		 247 aa  305  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  58.09 
 
 		 247 aa  304  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  58.51 
 
 		 242 aa  297  8e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  55.14 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  55.37 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  56.97 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  56.97 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  57.32 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  55.65 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  54.39 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  53.97 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  51.82 
 
 		 247 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  51.42 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  52.23 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  51.82 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  51.82 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  51.01 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  51.42 
 
 		 268 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  53.91 
 
 		 245 aa  271  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  51.43 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  50.61 
 
 		 247 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  51.43 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  49.8 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  48.54 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  51.97 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  43.95 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  43.95 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  40.25 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  44.8 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  44.26 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  36.21 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  37.86 
 
 		 249 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  34.22 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  35.71 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  32.08 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  33.89 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  33.89 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  35.56 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  32.22 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  34.67 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  32.44 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  34.22 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  33.19 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  23.79 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.26 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  24.31 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  23.25 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  27.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  27.36 
 
 		 295 aa  52.4  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.89 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>