276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1540 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  66.81 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  43.4 
 
 		 237 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  39.25 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  33.17 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  42.45 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  42.72 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  37.26 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  36.41 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  27.08 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  27.08 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.35 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  29.5 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  30.22 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  22.58 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  23.3 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  29.54 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  23.62 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.43 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0405  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000071012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.26 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  36.73 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.92 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  22.43 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  32.71 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  20.38 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  23.48 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.21 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.58 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  21.6 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0794  Methyltransferase type 12  27.17 
 
 		 404 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  21.3 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.47 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 365 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.04 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.62 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  20.95 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  22.22 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.08 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  32.92 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  22.13 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.39 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  28.26 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  31.55 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.76 
 
 		 356 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.54 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  20.34 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.06 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 346 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  35.8 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  18.98 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.37 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  23.62 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  20.34 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  19.92 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.67 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  24.88 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 360 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.06 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  28.45 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.04 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  37.25 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  37.25 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  30.72 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.92 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  20.85 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>