90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0794 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0794  Methyltransferase type 12  100 
 
 
404 aa  807    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
238 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  28.8 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
226 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.26 
 
 
213 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  28.09 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.9 
 
 
205 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1905  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.65 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
262 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
365 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
246 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.05 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  24.54 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.71 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  24.14 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
226 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  30 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
278 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
305 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  25.19 
 
 
202 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.5 
 
 
325 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  27.17 
 
 
229 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  31.82 
 
 
231 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
228 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  24.73 
 
 
307 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  25.23 
 
 
258 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
258 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  24.75 
 
 
235 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  23.02 
 
 
261 aa  46.6  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
230 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.44 
 
 
215 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.23 
 
 
234 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.26 
 
 
225 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
259 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.25 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  25 
 
 
269 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  24.84 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1605  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.93 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  24.35 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  25.68 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.71 
 
 
243 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  26.94 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1158  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase-like protein  31.07 
 
 
311 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  20.39 
 
 
250 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  20.39 
 
 
250 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2940  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.07 
 
 
311 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2786  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.07 
 
 
311 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  21.82 
 
 
223 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.14 
 
 
258 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
239 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  23.21 
 
 
191 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
224 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  25.21 
 
 
238 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.78 
 
 
258 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.25 
 
 
261 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  22.39 
 
 
207 aa  43.9  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  26.72 
 
 
564 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
218 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  26.13 
 
 
535 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
262 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
240 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.54 
 
 
249 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.93 
 
 
263 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.25 
 
 
221 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
234 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
269 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
217 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.94 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
223 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  26.21 
 
 
234 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.56 
 
 
259 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.03 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.25 
 
 
253 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.03 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.03 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
200 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
281 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3415  Methyltransferase type 12  26.73 
 
 
257 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428011  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
200 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.77 
 
 
257 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>