More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0530 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  32 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  31.91 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  27.72 
 
 		 238 aa  99  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  29.47 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  29.61 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  29.23 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  22.31 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3415  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.63 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  30.08 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.41 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  29.63 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  26.58 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  27.61 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.59 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.34 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  20.78 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.99 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.86 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.99 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0163  hypothetical protein  24.32 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  21.28 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  27.11 
 
 		 652 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0405  Methyltransferase type 12  25.15 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000071012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  30.28 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.23 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  30.28 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.97 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  30.28 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.34 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.34 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  30.28 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  31.4 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.33 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  30.28 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  25.42 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  30.28 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  26.76 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 779 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  27.34 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  31.25 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.82 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 349 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.65 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  30.25 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1085 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  31.03 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  30.77 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.16 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  22.54 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  29.91 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  28.7 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  35.64 
 
 		 414 aa  49.7  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  22.49 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 390 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>