35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0163 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0163  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3415  Methyltransferase type 12  41.33 
 
 
257 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428011  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  35.58 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
250 aa  132  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  26.41 
 
 
508 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4066  hypothetical protein  37.65 
 
 
84 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502822  unclonable  0.0000502924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2524  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  24.32 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  25.86 
 
 
209 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1689  methyltransferase type 12  23.63 
 
 
343 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  28.48 
 
 
621 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  29.75 
 
 
2867 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  26.62 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.71 
 
 
372 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2693  hypothetical protein  26.76 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591269  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.95 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2767  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.57 
 
 
382 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.24 
 
 
446 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1019  methyltransferase type 12  26.28 
 
 
358 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  21.56 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  25 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  23.08 
 
 
387 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.61 
 
 
431 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  23.08 
 
 
387 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  23.08 
 
 
387 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
236 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  22.67 
 
 
212 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 
221 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1154  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.93 
 
 
383 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>