184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5330 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  100 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  78.28 
 
 
221 aa  361  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  65.92 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  60.54 
 
 
224 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  56.5 
 
 
223 aa  259  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  57.85 
 
 
232 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  59.55 
 
 
232 aa  250  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  60.09 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  54.26 
 
 
223 aa  223  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  45.29 
 
 
240 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  35.92 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  31.56 
 
 
229 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  34.91 
 
 
243 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  30.67 
 
 
229 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  37.05 
 
 
235 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  37.05 
 
 
235 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  37.05 
 
 
235 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  38.04 
 
 
218 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  37.22 
 
 
237 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  35.71 
 
 
266 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  36.77 
 
 
237 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  36.32 
 
 
237 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  34.36 
 
 
237 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  27.23 
 
 
234 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.3 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  32.71 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  32.71 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  32.62 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  24.66 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  28.05 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  32.37 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.06 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  25.93 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  28.77 
 
 
249 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  24.29 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  23.53 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  21.57 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  23.68 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  26.57 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  23.36 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  25.24 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  25.36 
 
 
247 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.46 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  23.04 
 
 
234 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  35.14 
 
 
152 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
363 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  27.36 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  24.06 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  24.06 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  22.81 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  24.06 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  25.54 
 
 
288 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  24.15 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  22.81 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
250 aa  52  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  23.77 
 
 
251 aa  52  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.97 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  26.76 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  32.41 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  25.48 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  22.87 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  26.19 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
348 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  26.58 
 
 
274 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  28.32 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.59 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  23.67 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  23.19 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.82 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.62 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  21.95 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  25.35 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  25.23 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  24.56 
 
 
244 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>