159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1853 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  100 
 
 		 245 aa  513  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  58.85 
 
 		 244 aa  305  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  58.82 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  58.85 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  56.49 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  57.2 
 
 		 270 aa  295  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  57.55 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  57.14 
 
 		 245 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  56.9 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  56.43 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  55.97 
 
 		 267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  54.17 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  54.17 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  54.17 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  55.6 
 
 		 247 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  53.97 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  56.07 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  53.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  54.73 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  54.39 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  55.88 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  53.56 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  53.53 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  52.7 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  53.97 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  53.97 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  52.48 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  53.97 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  54.13 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  53.91 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  53.53 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  52.28 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  53.56 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  52.28 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  53.53 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  52.7 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  51.87 
 
 		 243 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  53.72 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  52.28 
 
 		 243 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  50.83 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  51.45 
 
 		 244 aa  258  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  53.11 
 
 		 243 aa  258  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  49.8 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  50.2 
 
 		 247 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  49.8 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  47.35 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  49.8 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  49.8 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  47.76 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  49.79 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  50.2 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  48.98 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  48.98 
 
 		 247 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  42.92 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  46.91 
 
 		 258 aa  210  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  40.86 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  39.04 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  38.65 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  38.11 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  36.82 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  35.71 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  36.4 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  35.56 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  36.73 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  36.18 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  36.73 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  36.73 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  33.89 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  35.92 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  35.4 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.4 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  33.19 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  33.02 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  21.82 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  23.79 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.79 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  29.94 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  28.35 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.2 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.17 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.56 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  22.87 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.2 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.48 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>