54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2488 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  58.95 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  58.52 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  57.89 
 
 		 237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  58.52 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  58.52 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  57.64 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  57.64 
 
 		 236 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  56.71 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  56.28 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  56.77 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  55.84 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  53.91 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  53.33 
 
 		 152 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  53.33 
 
 		 152 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  34.93 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  30.87 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.34 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  35.09 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  34.65 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  32.44 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  31.92 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  29.73 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  30.99 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  30.99 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  28.38 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  23.74 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  29.21 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.1 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  26.45 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 399 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1034  Methyltransferase type 12  33.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00209659  normal  0.0192304 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.53 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  33.53 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.93 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.93 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.93 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.93 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  32.93 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 249 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 400 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>