177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1654 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  70.18 
 
 		 237 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.03 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  48.43 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  46.05 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  32.88 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  29.67 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  25.34 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  35.44 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  24.43 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  31.55 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  33.18 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  29.2 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  36.68 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  36.68 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  31.77 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  32.28 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  38.5 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  38.3 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  31.77 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  29.65 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  29.36 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  28.96 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  34.67 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  29.47 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  34.21 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  34.21 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.34 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  32.57 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.25 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  31.06 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  25 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.65 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  24.06 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  21.13 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  33.89 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  30.87 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 292 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  32.46 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 358 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0378  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00156653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 262 aa  48.5  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1748  Methyltransferase type 12  24.48 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 306 aa  48.5  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.19 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  26.22 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_342  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase, methyltransferase type 12  24.73 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0343727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0399  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  27.08 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  24.68 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.98 
 
 		 414 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  31.34 
 
 		 474 aa  45.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  30.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 350 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  32.5 
 
 		 348 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 360 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 333 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.37 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  26.51 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.75 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>