120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2164 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  63.56 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  58.18 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  57.85 
 
 		 221 aa  258  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  56.05 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  56.5 
 
 		 224 aa  243  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  54.21 
 
 		 223 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  56.5 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  56.5 
 
 		 223 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  45.13 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  34.4 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  34.35 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  34.38 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  33.93 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  32.59 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  33.19 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  27.05 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  31.74 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  29.73 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  33.01 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  30.73 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  24.59 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  19.82 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  21.76 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  23.58 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  27.07 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  25.68 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  22.33 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  19.16 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  27.12 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  28.75 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  22.94 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  25.21 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  23.87 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  35.85 
 
 		 289 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4849  methyltransferase type 12  26.07 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  22.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  32.88 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  32.88 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  27.27 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  23.74 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  32.3 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  23.04 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  23.01 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  23.04 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  23.04 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  21.05 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  20.8 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  21.82 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  23.04 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  39.56 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3025  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.03 
 
 		 336 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  40.48 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  24.64 
 
 		 233 aa  45.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.66 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  23.29 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  23.29 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  23.29 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  23.29 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  23.29 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  22.02 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  19.14 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  27.65 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  20.54 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  27.17 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  22.12 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  21.46 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  21.46 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  21.46 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  21.86 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  21.86 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  21.88 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  21.86 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  21.46 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  21.46 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  21.46 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>