61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3848 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  94.04 
 
 		 266 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  91.49 
 
 		 236 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  90.64 
 
 		 236 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  88.03 
 
 		 234 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  71.91 
 
 		 237 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  71.06 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  70.04 
 
 		 237 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  71.06 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  63.79 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  58.52 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  70.67 
 
 		 152 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  70.67 
 
 		 152 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  30.13 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  27.51 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  35.78 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  35.09 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  37.05 
 
 		 221 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  27.51 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  35.85 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  35.45 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  36.59 
 
 		 243 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  36 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  34.51 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  34.2 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  35.06 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  34.08 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  30.87 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  29.96 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  31 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.37 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  20.99 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.81 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  36.54 
 
 		 414 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  36.61 
 
 		 407 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 312 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  35.58 
 
 		 399 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 585 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  23.31 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1676 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  32.17 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  33.59 
 
 		 400 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 390 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>