271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0079 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  57.32 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  55.83 
 
 
267 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  55.83 
 
 
267 aa  292  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  55.83 
 
 
267 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  57.32 
 
 
243 aa  291  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  56.02 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  55.19 
 
 
261 aa  288  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  55.83 
 
 
247 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  55.83 
 
 
247 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  55.42 
 
 
247 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  55.23 
 
 
241 aa  285  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  55.42 
 
 
247 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  56.25 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  56.9 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  55 
 
 
247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  54.17 
 
 
246 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  59.92 
 
 
244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  52.82 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  55.37 
 
 
243 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  55.37 
 
 
243 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  55.37 
 
 
243 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  56.3 
 
 
242 aa  280  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  54.81 
 
 
243 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  55 
 
 
247 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  56.07 
 
 
245 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  55.37 
 
 
243 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  55.88 
 
 
245 aa  279  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  54.36 
 
 
247 aa  279  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  55.46 
 
 
245 aa  278  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  53.97 
 
 
243 aa  278  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  54.39 
 
 
243 aa  278  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  53.56 
 
 
243 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  54.62 
 
 
242 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  53.56 
 
 
243 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  56.07 
 
 
244 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  51.46 
 
 
244 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  54.39 
 
 
243 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  52.72 
 
 
243 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  52.1 
 
 
244 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  55.23 
 
 
267 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  54.81 
 
 
270 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  51.25 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  51.45 
 
 
247 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  50.63 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  50.62 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  50.21 
 
 
247 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  50.21 
 
 
247 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  50.42 
 
 
250 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  50.21 
 
 
247 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  49.38 
 
 
246 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  48.96 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  47.72 
 
 
247 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  48.13 
 
 
252 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  46.89 
 
 
247 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  48.13 
 
 
247 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  48.97 
 
 
258 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  42.15 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  41.84 
 
 
270 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  41.3 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  41.3 
 
 
262 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  39.53 
 
 
274 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  40.89 
 
 
253 aa  174  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  35.83 
 
 
288 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  37.82 
 
 
249 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  40.59 
 
 
235 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  40.59 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  40.17 
 
 
235 aa  161  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  38.94 
 
 
235 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  36.4 
 
 
234 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  35.98 
 
 
234 aa  156  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  34.03 
 
 
234 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.4 
 
 
234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  33.2 
 
 
260 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  34.31 
 
 
234 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  35.56 
 
 
234 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  32 
 
 
242 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  28.5 
 
 
228 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  23.41 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.38 
 
 
295 aa  62  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.38 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  31.71 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  28.72 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  22.77 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.09 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  20.38 
 
 
229 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.93 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>