135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0912 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  60.54 
 
 
221 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  59.19 
 
 
240 aa  261  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  58.48 
 
 
221 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  60.71 
 
 
228 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  56.5 
 
 
232 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  55.14 
 
 
223 aa  236  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  56.05 
 
 
232 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  54.71 
 
 
223 aa  222  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  44.39 
 
 
240 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  31.22 
 
 
236 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  33.49 
 
 
218 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  36.25 
 
 
237 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  35.83 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  35.42 
 
 
237 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  34.51 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  34.05 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  31.7 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  30.8 
 
 
266 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  24.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  24 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  29.26 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  24.27 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  28.02 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  20.74 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  21.62 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  23.76 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  21.17 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  21.08 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  30.14 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  28.76 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  34.87 
 
 
152 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  34.87 
 
 
152 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  26.06 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  21.17 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  23.22 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  28.51 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  21.2 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  24.55 
 
 
242 aa  58.2  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  24.76 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  25 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  24.34 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  23.56 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  29.31 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  21.05 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  31.71 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  26.89 
 
 
247 aa  55.1  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  35 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  24.06 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  24.06 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  24.06 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  23.11 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  24.53 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  31.91 
 
 
220 aa  52  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  25.47 
 
 
247 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  36 
 
 
203 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.47 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  22.06 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  23.25 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  25 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4849  methyltransferase type 12  26.19 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  26.05 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  23.08 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  26.57 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  24.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  24.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  25.12 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  23.35 
 
 
245 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  32.04 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  23.58 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  21.33 
 
 
245 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  31.82 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  25.94 
 
 
274 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  20.98 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.79 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  24.41 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  22.51 
 
 
351 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.29 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>