189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3251 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  85.65 
 
 
224 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  36.99 
 
 
236 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  38.14 
 
 
243 aa  121  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  40.72 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  40.27 
 
 
237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  39.82 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
236 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  31.22 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  37.04 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 
234 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  36.75 
 
 
266 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
228 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  36.05 
 
 
237 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  29.86 
 
 
229 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  34.2 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
236 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  34.65 
 
 
238 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  33.49 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  32.72 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  32.71 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  28.89 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  31.73 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  35.06 
 
 
244 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  28.16 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  31.34 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  39.61 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  39.61 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  30.14 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  28.78 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.79 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  27.62 
 
 
234 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.8 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.04 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  35.11 
 
 
268 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  24.75 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
281 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.88 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
309 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  31.97 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  34.59 
 
 
414 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.5 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5884  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.2 
 
 
422 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0711978  normal  0.210944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
305 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  28.7 
 
 
509 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1388  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.48 
 
 
407 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.420857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  23.11 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  46.15 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
391 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3031  O-methyltransferase family protein  31.96 
 
 
252 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.92 
 
 
283 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 
205 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.51 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  33.82 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.47 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  34 
 
 
306 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.66 
 
 
394 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  24.78 
 
 
521 aa  46.6  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.66 
 
 
395 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.36 
 
 
394 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  35.42 
 
 
285 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.93 
 
 
310 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  25.23 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  33.01 
 
 
287 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  30 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
187 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  30 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.4 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
440 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  25.23 
 
 
235 aa  45.1  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.99 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  26.24 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
280 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  40 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.37 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>