251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3031 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3031  O-methyltransferase family protein  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1915  O-methyltransferase family protein  66.24 
 
 
251 aa  305  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0767141  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8039  O-methyltransferase  52.78 
 
 
240 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.957053  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0629  O-methyltransferase family 3  54.03 
 
 
219 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00645598  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0966  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  51.4 
 
 
219 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.306907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9023  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  50.72 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1093  O-methyltransferase family 3  48.82 
 
 
219 aa  211  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0468  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  49.54 
 
 
220 aa  211  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0793  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  51.39 
 
 
217 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0850  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  51.4 
 
 
217 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2810  O-methyltransferase family 3  47.44 
 
 
216 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189293  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2512  O-methyltransferase family 3  49.06 
 
 
220 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0525  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  43.98 
 
 
220 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4618  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  47.89 
 
 
218 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  hitchhiker  0.000409196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1264  O-methyltransferase family protein  43.32 
 
 
220 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0114  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  42.2 
 
 
220 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37392  predicted protein  42.92 
 
 
212 aa  176  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000419488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4178  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00335218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3895  O-methyltransferase family 3  42.13 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48780  hypothetical protein  41.2 
 
 
220 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114674  hitchhiker  0.000000463304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2095  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  44.55 
 
 
226 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3189  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  44.66 
 
 
220 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.873252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3278  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  43 
 
 
218 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.507462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1748  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  40 
 
 
219 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2427  O-methyltransferase family protein  41.35 
 
 
233 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0966  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  42.45 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3263  O-methyltransferase family protein  39.9 
 
 
220 aa  160  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2231  hypothetical protein  39.81 
 
 
218 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2203  hypothetical protein  39.35 
 
 
218 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0681  O-methyltransferase family 3  40.57 
 
 
221 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3434  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  38.76 
 
 
220 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2682  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  38.76 
 
 
220 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1652  O-methyltransferase family protein  40.09 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2051  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  39.81 
 
 
213 aa  150  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0473  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  41.4 
 
 
214 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  37.38 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2897  O-methyltransferase family 3  36.62 
 
 
213 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.262328 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0566  hypothetical protein  38.76 
 
 
215 aa  143  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.168905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1151  O-methyltransferase  34.86 
 
 
222 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1021  O-methyltransferase  34.86 
 
 
222 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7922  O-methyltransferase family 3  38.5 
 
 
256 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1776  O-methyltransferase family protein  35.81 
 
 
213 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2374  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  34.42 
 
 
235 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00402634  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0193  O-methyltransferase family 3  40.91 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3031  O-methyltransferase  38.03 
 
 
215 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0664  O-methyltransferase family 3  41.12 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07450  O-methyltransferase family protein  36.62 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6910  O-methyltransferase family 3  36.84 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283882  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2598  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  42.35 
 
 
208 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136374  hitchhiker  0.0000823112 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2505  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  35.51 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0398755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13360  predicted O-methyltransferase  36.36 
 
 
220 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.693653  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4298  O-methyltransferase family protein  38.25 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1933  O-methyltransferase family protein  37.19 
 
 
245 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.744837  hitchhiker  0.0000011489 
 
 
-
 
NC_002950  PG1730  O-methyltransferase family protein  34.95 
 
 
216 aa  125  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0986  O-methyltransferase family protein  36.22 
 
 
222 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0388  O-methyltransferase family protein  36.22 
 
 
222 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0253  O-methyltransferase family protein  36.22 
 
 
222 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1839  O-methyltransferase family protein  36.22 
 
 
222 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1343  O-methyltransferase family protein  36.22 
 
 
222 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1827  O-methyltransferase family protein  36.22 
 
 
237 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1754  O-methyltransferase family protein  35.71 
 
 
222 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2066  O-methyltransferase  36.87 
 
 
223 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000833966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0314  O-methyltransferase family protein  35.2 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0301267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2965  O-methyltransferase family protein  37.25 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2045  O-methyltransferase, putative  35.71 
 
 
223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1776  O-methyltransferase  36.22 
 
 
223 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3782  O-methyltransferase family 3  32.13 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.955684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2832  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  38.38 
 
 
225 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14350  predicted O-methyltransferase  35.94 
 
 
229 aa  118  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.272747  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3865  O-methyltransferase family 3  32.13 
 
 
225 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2976  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.774048  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5032  O-methyltransferase family protein  35.89 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404122  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1627  O-methyltransferase family 3  37.24 
 
 
235 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3725  O-methyltransferase family protein  32.72 
 
 
220 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4982  O-methyltransferase family 3  34.89 
 
 
279 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.470572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5071  O-methyltransferase  31.58 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3857  O-methyltransferase family protein  35.22 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.615697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1677  O-methyltransferase family protein  32.23 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.498636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4258  O-methyltransferase family 3  32.42 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5429  O-methyltransferase family protein  35.41 
 
 
222 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2122  O-methyltransferase family protein  36.74 
 
 
220 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01450  predicted O-methyltransferase  33.48 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.580973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0144  O-methyltransferase family protein  36.25 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0960801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0153  O-methyltransferase family protein  36.25 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4649  O-methyltransferase family 3  36.02 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1123  O-methyltransferase family protein  34.18 
 
 
233 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0443703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2978  O-methyltransferase family protein  34.32 
 
 
209 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10188  O-methyltransferase  37.91 
 
 
218 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.153182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0134  O-methyltransferase family protein  35.62 
 
 
221 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.670922  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03330  O-methyltransferase, putative  32.61 
 
 
300 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3051  O-methyltransferase family 3  34.1 
 
 
212 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4599  O-methyltransferase family protein  32.66 
 
 
223 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3245  O-methyltransferase family 3  33.65 
 
 
217 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0450079  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4674  O-methyltransferase family protein  36.31 
 
 
222 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3689  O-methyltransferase family protein  36.31 
 
 
222 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2421  O-methyltransferase family protein  34.6 
 
 
222 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4503  O-methyltransferase family protein  28.57 
 
 
213 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.98253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4077  O-methyltransferase family protein  35.76 
 
 
223 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00728194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0154  O-methyltransferase family protein  35 
 
 
220 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177902  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0514  O-methyltransferase family protein  33.75 
 
 
220 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>