256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1748 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1748  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  100 
 
 
219 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48780  hypothetical protein  74.09 
 
 
220 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114674  hitchhiker  0.000000463304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4178  hypothetical protein  73.64 
 
 
220 aa  323  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00335218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0525  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  59.09 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2512  O-methyltransferase family 3  60.45 
 
 
220 aa  241  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0739211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2427  O-methyltransferase family protein  51.36 
 
 
233 aa  224  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1264  O-methyltransferase family protein  52.73 
 
 
220 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0114  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  50 
 
 
220 aa  222  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0681  O-methyltransferase family 3  52.05 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3895  O-methyltransferase family 3  52.73 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1652  O-methyltransferase family protein  54.09 
 
 
224 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2682  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  50 
 
 
220 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3434  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  49.55 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3263  O-methyltransferase family protein  47.27 
 
 
220 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1151  O-methyltransferase  49.32 
 
 
222 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1021  O-methyltransferase  49.32 
 
 
222 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0966  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  53.64 
 
 
222 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2203  hypothetical protein  46.98 
 
 
218 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2231  hypothetical protein  46.51 
 
 
218 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0629  O-methyltransferase family 3  49.32 
 
 
219 aa  191  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00645598  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2374  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  44.95 
 
 
235 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00402634  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0966  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  46.15 
 
 
219 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.306907  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37392  predicted protein  47.42 
 
 
212 aa  185  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000419488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0468  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  50 
 
 
220 aa  181  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3189  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  49.76 
 
 
220 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.873252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3278  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  50.24 
 
 
218 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.507462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8039  O-methyltransferase  46.45 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.957053  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1093  O-methyltransferase family 3  42.99 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1915  O-methyltransferase family protein  46.63 
 
 
251 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0767141  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3031  O-methyltransferase family protein  40 
 
 
252 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9023  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  42.52 
 
 
215 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4618  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  42.27 
 
 
218 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  hitchhiker  0.000409196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2810  O-methyltransferase family 3  46.01 
 
 
216 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189293  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0793  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  42.53 
 
 
217 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2832  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  41.33 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0850  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  42.01 
 
 
217 aa  158  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2095  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  41.89 
 
 
226 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7922  O-methyltransferase family 3  40.78 
 
 
256 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2897  O-methyltransferase family 3  36.87 
 
 
213 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.262328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0473  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  39.2 
 
 
214 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2051  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  35.98 
 
 
213 aa  142  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3031  O-methyltransferase  35.41 
 
 
215 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  37.09 
 
 
211 aa  141  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0566  hypothetical protein  36.15 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.168905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0193  O-methyltransferase family 3  46.5 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0333  O-methyltransferase family protein  36.55 
 
 
225 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3782  O-methyltransferase family 3  41.21 
 
 
225 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.955684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07450  O-methyltransferase family protein  35.85 
 
 
213 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3865  O-methyltransferase family 3  41.21 
 
 
225 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1776  O-methyltransferase family protein  35.21 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3725  O-methyltransferase family protein  41.71 
 
 
220 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2505  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  39.61 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0398755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0553  O-methyltransferase family 3  37.67 
 
 
225 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14350  predicted O-methyltransferase  34.74 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.272747  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2166  O-methyltransferase family 3  38.61 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132744  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2976  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  35.04 
 
 
276 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.774048  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4982  O-methyltransferase family 3  42.05 
 
 
279 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.470572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1827  O-methyltransferase family protein  33.33 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2066  O-methyltransferase  34.52 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000833966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0154  O-methyltransferase family protein  38.18 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177902  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1627  O-methyltransferase family 3  37.13 
 
 
235 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2598  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  34.58 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136374  hitchhiker  0.0000823112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0514  O-methyltransferase family protein  35.35 
 
 
220 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437262  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5071  O-methyltransferase  30.14 
 
 
212 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1933  O-methyltransferase family protein  35.64 
 
 
245 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.744837  hitchhiker  0.0000011489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1677  O-methyltransferase family protein  36.11 
 
 
222 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.498636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4298  O-methyltransferase family protein  35.2 
 
 
221 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1776  O-methyltransferase  32.51 
 
 
223 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01450  predicted O-methyltransferase  39.56 
 
 
223 aa  121  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.580973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2045  O-methyltransferase, putative  32.99 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6910  O-methyltransferase family 3  40.24 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283882  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4649  O-methyltransferase family 3  42.07 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2965  O-methyltransferase family protein  36.5 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0598  O-methyltransferase family protein  34.93 
 
 
209 aa  119  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.54088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3436  O-methyltransferase family protein  32.7 
 
 
210 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3857  O-methyltransferase family protein  37.56 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.615697 
 
 
-
 
NC_002978  WD1057  O-methyltransferase family protein  32.78 
 
 
215 aa  118  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.773239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1730  O-methyltransferase family protein  33.18 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5032  O-methyltransferase family protein  43.54 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404122  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4599  O-methyltransferase family protein  37.16 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4258  O-methyltransferase family 3  38.86 
 
 
284 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2421  O-methyltransferase family protein  42.57 
 
 
222 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0299  O-methyltransferase family 3  36.52 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5429  O-methyltransferase family protein  41.22 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4391  O-methyltransferase family 3  37.38 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000075162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0664  O-methyltransferase family 3  42.6 
 
 
211 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4077  O-methyltransferase family protein  38.1 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00728194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0279  O-methyltransferase family 3  32.09 
 
 
207 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2122  O-methyltransferase family protein  40.54 
 
 
220 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13360  predicted O-methyltransferase  37.2 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.693653  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4674  O-methyltransferase family protein  41.22 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3689  O-methyltransferase family protein  41.22 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1209  O-methyltransferase family protein  40.51 
 
 
165 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.81955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0144  O-methyltransferase family protein  35 
 
 
221 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0960801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0153  O-methyltransferase family protein  35 
 
 
221 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0134  O-methyltransferase family protein  35 
 
 
221 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.670922  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3051  O-methyltransferase family 3  33.64 
 
 
212 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0314  O-methyltransferase family protein  38.18 
 
 
222 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0301267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0058  O-methyltransferase family protein  39.07 
 
 
225 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233872 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03330  O-methyltransferase, putative  30.51 
 
 
300 aa  106  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>