More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1203 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  100 
 
 
239 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  55.13 
 
 
235 aa  277  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  50.64 
 
 
235 aa  261  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 
240 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  47.28 
 
 
246 aa  228  6e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  29.2 
 
 
225 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.33 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  27.62 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  28.28 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  26.8 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  23.28 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  27.75 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  25.24 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  27.4 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  27.4 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  27.4 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  27.4 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  21.5 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  38.53 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  27.88 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  27.88 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  27.88 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  26.37 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  27.88 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  29.92 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  26.45 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  27.86 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  27.59 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  34.51 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  25.27 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 
314 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  28.28 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  27.4 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  28.9 
 
 
295 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  24.52 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  21.95 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
335 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  34.23 
 
 
223 aa  55.1  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
283 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  30.19 
 
 
343 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  33.64 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  29.86 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  30.34 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  30 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  29.12 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  24.43 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  33.07 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  23.38 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  24.43 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  24.43 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  25.12 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  27.51 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  29.17 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  31.78 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  24.65 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.17 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.17 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  29.17 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  23.98 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.17 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.59 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.512948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  23.7 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  23.98 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  24.27 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  29.17 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  29.17 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  27.59 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  30.53 
 
 
631 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.01 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  29.17 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  28.5 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.28 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>