43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1662 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  100 
 
 
237 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  99.34 
 
 
237 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
152 aa  298  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  298  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  98.03 
 
 
237 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  93.42 
 
 
237 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  71.33 
 
 
236 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  70.67 
 
 
234 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  70 
 
 
236 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  70.39 
 
 
266 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  70.67 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  70.67 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  70.67 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  56 
 
 
244 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  53.33 
 
 
238 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 
234 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  35.67 
 
 
236 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  35.76 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  34.87 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  30.07 
 
 
229 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.1 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  38.56 
 
 
228 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  35.06 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  36.18 
 
 
223 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  39.61 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  34.87 
 
 
224 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  36.84 
 
 
224 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  35.14 
 
 
221 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  30.92 
 
 
240 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  29.49 
 
 
237 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  31.61 
 
 
221 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  30.92 
 
 
223 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  32.67 
 
 
232 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  32.88 
 
 
232 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.86 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  31.17 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  31.51 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  32.5 
 
 
394 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  34.32 
 
 
243 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
1759 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.48 
 
 
394 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>