136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3655 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  78.28 
 
 		 221 aa  361  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  64.13 
 
 		 240 aa  305  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  58.48 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  56.54 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  57.73 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  56.05 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  58.04 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  54.71 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  45.7 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  32.68 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 236 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  33.62 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  30.22 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  35.09 
 
 		 266 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  33.69 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  31.77 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  33.04 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  32.61 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  30.87 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.41 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  32.42 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  26.17 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  27.23 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.82 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  23.29 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  27.96 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  35.34 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  27.44 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.21 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  24.34 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  23.11 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 363 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  22.37 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  20.89 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.58 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  22.22 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  31.61 
 
 		 152 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  31.61 
 
 		 152 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  26.17 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  28.36 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  21.27 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  22.22 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.03 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.82 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  23.83 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.32 
 
 		 263 aa  48.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.05 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  26.19 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.76 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  24.53 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  30.09 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  31.86 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  26.09 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  20.75 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  23.38 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  28.07 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  29.25 
 
 		 352 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 348 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  28.07 
 
 		 351 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.56 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  26.14 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  26.05 
 
 		 351 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.15 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.94 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  30.97 
 
 		 629 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  23.13 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  17.73 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  21.52 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  22.27 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  21.9 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  23.39 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>