64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2578 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  100 
 
 
237 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  98.73 
 
 
237 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  97.89 
 
 
237 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  88.61 
 
 
237 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  72.15 
 
 
236 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  71.31 
 
 
236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  71.73 
 
 
266 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  71.06 
 
 
234 aa  316  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  71.91 
 
 
235 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  71.91 
 
 
235 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  71.91 
 
 
235 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
152 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  58.44 
 
 
244 aa  224  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  56.71 
 
 
238 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
228 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  33.47 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.86 
 
 
229 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  40.61 
 
 
228 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  36.25 
 
 
224 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.05 
 
 
229 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  36.32 
 
 
218 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  32.74 
 
 
240 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  40.72 
 
 
224 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  36.28 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  38.81 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  36.44 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  37.22 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  33.48 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  33.04 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  34.38 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  36.03 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  35.11 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  31.95 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  29.77 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  28.1 
 
 
267 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  32.73 
 
 
394 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.83 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  31.82 
 
 
394 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.5 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  29.48 
 
 
407 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.43 
 
 
273 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  32 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  32.98 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  31.58 
 
 
400 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  31.71 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.54 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  20.68 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2608  hypothetical protein  24.79 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42 
 
 
394 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
280 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
190 aa  42  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  20.68 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  23.97 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>