More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1989 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  100 
 
 
218 aa  448  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  43.13 
 
 
225 aa  177  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  44.86 
 
 
208 aa  174  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  29.47 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  28.82 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.24 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.36 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.61 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.5 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.28 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
307 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  34.75 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.75 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.75 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.62 
 
 
251 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
317 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  32.11 
 
 
267 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.6 
 
 
260 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
225 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
243 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  30.07 
 
 
252 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.48 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  30.71 
 
 
309 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  32.31 
 
 
267 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.9 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
274 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  33.04 
 
 
353 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
365 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
353 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  35.58 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 
274 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
269 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.65 
 
 
258 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  38.96 
 
 
263 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.77 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
262 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
269 aa  55.1  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
1106 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.07 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.64 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
303 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2223  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128403  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  37.63 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  29.41 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  29.41 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.12 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  38.1 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  28.46 
 
 
304 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.64 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  31.96 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
282 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.14 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  37 
 
 
658 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  38.1 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>