172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2545 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  56.07 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  51.26 
 
 		 260 aa  254  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  40.59 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  42.26 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  42.44 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  41.6 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  43.7 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  39.83 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  39.09 
 
 		 243 aa  178  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  37.86 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  39 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  39.58 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  37.86 
 
 		 243 aa  175  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  38.75 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  37.86 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  39.09 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  39.09 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  38.08 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  39.51 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  40.66 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  38.27 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  38.49 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  38.49 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  37.82 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  38.68 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  36.82 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  38.08 
 
 		 246 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  37.08 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  37.76 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  37.04 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  36.21 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  38.91 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  39.42 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  36.97 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  36.4 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  36.4 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  36.4 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  37.08 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  37.66 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  37.24 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  39.66 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  38.78 
 
 		 235 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  34.73 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  38.91 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  38.59 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  37.8 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  37.24 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  36.4 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  36.4 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  35.98 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  35.51 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  37.33 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  39.08 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  37.34 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  36.51 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  36.55 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  36.25 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  37.76 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  36.33 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  36.93 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  36.51 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  36.07 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  36.14 
 
 		 268 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  35.92 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  36.33 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  35.62 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  33.88 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  34.27 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  34.27 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  24.22 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  28.77 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  23.01 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.51 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  23.62 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  22.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  21.4 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  28.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  22.27 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  21.05 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  22.37 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>