116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2311 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  100 
 
 
288 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  56.07 
 
 
249 aa  290  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  52.72 
 
 
260 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  45.81 
 
 
235 aa  192  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  38.59 
 
 
243 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  40.74 
 
 
245 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  38.68 
 
 
243 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  38.68 
 
 
243 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  38.68 
 
 
243 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  38.68 
 
 
243 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  38.68 
 
 
243 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  39.42 
 
 
243 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  39 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  41.59 
 
 
234 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  38.17 
 
 
243 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  36.21 
 
 
243 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  38.17 
 
 
243 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  38.17 
 
 
252 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  35.68 
 
 
243 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  35.27 
 
 
243 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  38.11 
 
 
245 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  38.33 
 
 
243 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  37.92 
 
 
243 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  37.76 
 
 
247 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  35.98 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  37.66 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  38.75 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  36.67 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  37.24 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  36.67 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  36.67 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  36.67 
 
 
247 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  36.67 
 
 
247 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  36.67 
 
 
247 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  36.67 
 
 
247 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  36.67 
 
 
247 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  36.25 
 
 
247 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  35 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  37.6 
 
 
241 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  36.25 
 
 
246 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  37.92 
 
 
234 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  35.83 
 
 
251 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  34.96 
 
 
244 aa  168  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  35.42 
 
 
246 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  37.76 
 
 
247 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  38.31 
 
 
253 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  36.93 
 
 
247 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  38.75 
 
 
234 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  36.93 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  37.76 
 
 
247 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  37.92 
 
 
235 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  39.17 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  37.8 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  39.27 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  37.8 
 
 
235 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  36.67 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  37.08 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  38.11 
 
 
234 aa  162  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  35.42 
 
 
234 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  38.25 
 
 
252 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  40.42 
 
 
234 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  33.74 
 
 
242 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  39.47 
 
 
250 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  38.68 
 
 
246 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  35.42 
 
 
243 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  37.65 
 
 
247 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  37.39 
 
 
228 aa  152  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  35 
 
 
270 aa  152  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  36.03 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  35.5 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  36.25 
 
 
247 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  34.82 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  36.25 
 
 
247 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  34.82 
 
 
247 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  35.63 
 
 
247 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  34.63 
 
 
258 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  34.47 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  34.47 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  33.47 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  29.15 
 
 
242 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  26.87 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  24.76 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  23.85 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  25.54 
 
 
221 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  25.38 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  25.21 
 
 
232 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  25 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  24.89 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  27.81 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  26.17 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  34.52 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>