113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4366 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  100 
 
 		 268 aa  543  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  97.98 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  97.17 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  94.74 
 
 		 247 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  84.62 
 
 		 247 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  83.81 
 
 		 247 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  83.81 
 
 		 247 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  80.97 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  79.35 
 
 		 247 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  79.59 
 
 		 246 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  77.29 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  57.68 
 
 		 246 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  56.79 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  56.68 
 
 		 267 aa  291  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  56.68 
 
 		 267 aa  291  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  56.68 
 
 		 267 aa  291  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  55.97 
 
 		 245 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  57.68 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  58.09 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  56.02 
 
 		 247 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  53.25 
 
 		 243 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  56.43 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  56.02 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  55.6 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  55.6 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  55.6 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  55.6 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  55.6 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  54.03 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  55.69 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  54.77 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  56.1 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  54.36 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  54.36 
 
 		 247 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  53.09 
 
 		 242 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 247 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  54.51 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  51.42 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  54.36 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  51.42 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  53.94 
 
 		 243 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  51.85 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  53.53 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  53.94 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  53.53 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  53.31 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  53.94 
 
 		 243 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  53.09 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  52.87 
 
 		 242 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  51.01 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  52.61 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  50.62 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  52.03 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  51.65 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  52.03 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  49.8 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  50.62 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  47.95 
 
 		 243 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  48.13 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  43.65 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  41.8 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  41 
 
 		 262 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  42.91 
 
 		 245 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  39.85 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  35.5 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  34.71 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  36.14 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  34.17 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  33.73 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  36.89 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  36.89 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  36.89 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  34.16 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  36.48 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  32.51 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  33.47 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  32.78 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  28.89 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  33.88 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  25.36 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  26.2 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  36.47 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  26.84 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>