113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1269 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  34.08 
 
 
228 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  34.98 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  37.22 
 
 
235 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  37.05 
 
 
235 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  37.05 
 
 
235 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  32 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  32 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  36.77 
 
 
234 aa  133  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  31.56 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  30.67 
 
 
243 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  34.53 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  30.67 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  30.42 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  30.67 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  30.67 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  30.22 
 
 
243 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  31.9 
 
 
235 aa  122  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  33.18 
 
 
234 aa  122  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  31.88 
 
 
245 aa  121  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  31.7 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  31.86 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  31.56 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  31.25 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  30.93 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  33.18 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  30.51 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  32.46 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  32.74 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  30.26 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  30.25 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  31.07 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  30.97 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  31.07 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  31.07 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  29.33 
 
 
243 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  32 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  31.47 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  31.9 
 
 
247 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  26.96 
 
 
244 aa  111  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  28.51 
 
 
270 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  31.2 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  30.57 
 
 
250 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  28 
 
 
243 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  29.74 
 
 
247 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  29.86 
 
 
244 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  28.82 
 
 
247 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  29.15 
 
 
244 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  28.32 
 
 
260 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  28.63 
 
 
243 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  27.56 
 
 
243 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  29.78 
 
 
246 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  30.34 
 
 
252 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  28.25 
 
 
270 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  29.15 
 
 
288 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  29.22 
 
 
245 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  28.07 
 
 
247 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  29.22 
 
 
245 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  28.46 
 
 
267 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  27.11 
 
 
243 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  28.76 
 
 
242 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  29.18 
 
 
247 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  28.19 
 
 
249 aa  99  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  28.31 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  26.92 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  26.92 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  27.04 
 
 
247 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  27.04 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  26.07 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  28.75 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  29.58 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  28.33 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  31.3 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  28.71 
 
 
1274 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.82 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.31 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  26.67 
 
 
242 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  25 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>