186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2880 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  100 
 
 
244 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  95.49 
 
 
270 aa  484  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  84.02 
 
 
267 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  79.92 
 
 
244 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  63.18 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  63.18 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  62.76 
 
 
245 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  308  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  61.09 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  61.09 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  61.09 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  61.09 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  61.09 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  61.09 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  61.09 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  61.09 
 
 
247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  60.25 
 
 
246 aa  302  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  58.85 
 
 
245 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  59.02 
 
 
243 aa  299  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  58.61 
 
 
243 aa  298  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  58.51 
 
 
267 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  58.51 
 
 
267 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  58.51 
 
 
267 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  59.17 
 
 
250 aa  291  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  58.2 
 
 
243 aa  291  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  59.02 
 
 
244 aa  291  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  59.02 
 
 
243 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  56.97 
 
 
243 aa  291  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  59.02 
 
 
243 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  59.02 
 
 
252 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  60.42 
 
 
247 aa  290  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  60.67 
 
 
247 aa  290  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  60.25 
 
 
261 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  58.61 
 
 
243 aa  288  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  58.61 
 
 
243 aa  288  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  57.32 
 
 
247 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  58.2 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  58.2 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  58.2 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  58.2 
 
 
243 aa  284  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  56.5 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  57.38 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  56.5 
 
 
247 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  56.1 
 
 
247 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  56.07 
 
 
241 aa  280  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  56.1 
 
 
268 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  56.15 
 
 
243 aa  276  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  55.28 
 
 
247 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  54.88 
 
 
247 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  55.97 
 
 
246 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  55.28 
 
 
247 aa  272  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  56.07 
 
 
251 aa  270  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  54.88 
 
 
247 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  53.14 
 
 
270 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  55.14 
 
 
252 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  52.92 
 
 
244 aa  265  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  52.7 
 
 
242 aa  265  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  52.65 
 
 
243 aa  262  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  51.65 
 
 
243 aa  259  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  46.22 
 
 
274 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  46.03 
 
 
262 aa  222  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  45.24 
 
 
262 aa  218  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  48.98 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  42.92 
 
 
245 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  38.75 
 
 
249 aa  174  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  38.75 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  38.08 
 
 
234 aa  168  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  36.93 
 
 
260 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  38.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  33.47 
 
 
234 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  36.25 
 
 
235 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  37.6 
 
 
234 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  34.73 
 
 
234 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.4 
 
 
234 aa  142  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  35.4 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  35.4 
 
 
235 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  35.4 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  32.22 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  30.18 
 
 
228 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  29.15 
 
 
242 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  25.24 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  34.88 
 
 
307 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  23.11 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.56 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  23.08 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  33.72 
 
 
208 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>