124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  96.75 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  82.04 
 
 		 247 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  82.38 
 
 		 247 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  79.59 
 
 		 247 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  77.96 
 
 		 247 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  79.59 
 
 		 268 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  78.78 
 
 		 247 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  78.37 
 
 		 247 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  77.55 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  78.1 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  55.1 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  54.92 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  55.74 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  55.51 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  53.28 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  55.92 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  54.73 
 
 		 267 aa  278  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  54.73 
 
 		 267 aa  278  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  54.73 
 
 		 267 aa  278  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  53.47 
 
 		 247 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 247 aa  277  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 247 aa  277  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 247 aa  277  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  53.06 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  54.29 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  53.88 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  53.47 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  53.06 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  55.97 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  53.28 
 
 		 243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  53.88 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  53.53 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  53.53 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  53.53 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  53.28 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  51.43 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  55.14 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  53.53 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  53.11 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  51.64 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  50.61 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  51.65 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  52.87 
 
 		 244 aa  264  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  52.7 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  52.7 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  52.7 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  50.2 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  54.13 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  50.41 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  51.64 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  50.2 
 
 		 243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  51.85 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  49.39 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  49.59 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  50.41 
 
 		 243 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  49.38 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  47.54 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  43.15 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  43.08 
 
 		 274 aa  190  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  42.51 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  40.08 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  40.48 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  38.33 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  38.68 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  36.73 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  35.95 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  37.7 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  36.51 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  36.1 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  35.54 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  35.54 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  35.68 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  35.39 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.1 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  35.27 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  30.99 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  27.11 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  28.43 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.61 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.56 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.65 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 2112 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  31.58 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.64 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>