173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1403 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  100 
 
 		 270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  95.49 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  82 
 
 		 267 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  77.87 
 
 		 244 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  61.09 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  61.09 
 
 		 245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  61.09 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  60.67 
 
 		 242 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  60.25 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  59.83 
 
 		 247 aa  298  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  59.83 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  59.83 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  59.41 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  59.41 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  59.41 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  59.83 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  57.2 
 
 		 245 aa  295  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  60.25 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  61.51 
 
 		 247 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  59 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  58.58 
 
 		 246 aa  291  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  58.58 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  54.69 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  54.69 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  59 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  59.17 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  57.32 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  58.16 
 
 		 243 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  58.58 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  58.58 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  58.58 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  56.67 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  58.58 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  56.07 
 
 		 241 aa  282  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  58.16 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  57.68 
 
 		 244 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  58.16 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  58.16 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  58.16 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  58.16 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  55.69 
 
 		 247 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  55.28 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  54.88 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  56.43 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  55.28 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  54.51 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  55.19 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  53.33 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  55.14 
 
 		 246 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  53.66 
 
 		 247 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  54.92 
 
 		 243 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  52.72 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  54.07 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  54.22 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  54.81 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  51.87 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  53.66 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  52.92 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  51.24 
 
 		 243 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  45.63 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  44.4 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  45.06 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  47.35 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  42.5 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  37.08 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  37.24 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  37.08 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  35.29 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  37.6 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  38.5 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  35.83 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  32.64 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.67 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  34.31 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  35.4 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  35.4 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  35.4 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  31.8 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  29.73 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  28.25 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  33.82 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  24.76 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  24.34 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  24.45 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  32.14 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.43 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>