193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2368 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  77.37 
 
 
243 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  78.6 
 
 
243 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  76.95 
 
 
243 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  74.07 
 
 
243 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  73.25 
 
 
243 aa  390  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  73.25 
 
 
243 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  73.66 
 
 
243 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  73.66 
 
 
243 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  73.66 
 
 
243 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  73.25 
 
 
252 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  73.66 
 
 
243 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  73.66 
 
 
243 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  72.84 
 
 
244 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  69.55 
 
 
243 aa  370  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  67.9 
 
 
243 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  62.76 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  61 
 
 
245 aa  315  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  60.58 
 
 
245 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  59.83 
 
 
267 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  59.83 
 
 
267 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  59.83 
 
 
267 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  308  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  308  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  59.34 
 
 
247 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  308  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  308  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  307  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  58.51 
 
 
242 aa  305  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  58.92 
 
 
247 aa  305  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  57.08 
 
 
247 aa  301  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  57.26 
 
 
246 aa  299  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  58.61 
 
 
244 aa  298  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  57.92 
 
 
241 aa  298  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  57.32 
 
 
251 aa  297  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  57.92 
 
 
247 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  57.08 
 
 
261 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  57.68 
 
 
247 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  56.97 
 
 
244 aa  294  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  57.26 
 
 
247 aa  293  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  58.58 
 
 
270 aa  291  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  54.73 
 
 
243 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  54.47 
 
 
247 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  56.02 
 
 
242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  55.65 
 
 
267 aa  284  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  55.74 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  55.33 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  53.25 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  53.25 
 
 
247 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  53.25 
 
 
268 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  53.66 
 
 
247 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  53.56 
 
 
243 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  52.85 
 
 
247 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  53.25 
 
 
247 aa  275  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  52.85 
 
 
247 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  52.89 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  52.48 
 
 
245 aa  272  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  50.81 
 
 
247 aa  261  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  50.84 
 
 
250 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  46.47 
 
 
270 aa  241  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  40.66 
 
 
245 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  43.55 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  43.15 
 
 
262 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  45.16 
 
 
258 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  42.8 
 
 
274 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  35.27 
 
 
288 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  37.86 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  36.07 
 
 
253 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  32.77 
 
 
234 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  36.97 
 
 
235 aa  152  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  33.47 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  33.47 
 
 
234 aa  148  8e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  31.67 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  34.31 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  33.61 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  33.78 
 
 
235 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  33.78 
 
 
235 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  34.22 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  31.11 
 
 
234 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  30.77 
 
 
228 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  28 
 
 
242 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  26.07 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  24.2 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  30.09 
 
 
314 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.31 
 
 
248 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.71 
 
 
252 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  21.95 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>