204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2309 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  99.59 
 
 
243 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  98.77 
 
 
243 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  91.77 
 
 
243 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  91.77 
 
 
252 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  90.95 
 
 
243 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  90.53 
 
 
243 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  80.66 
 
 
243 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  76.95 
 
 
244 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  75.31 
 
 
243 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  76.54 
 
 
243 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  75.72 
 
 
243 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  73.66 
 
 
243 aa  391  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  69.55 
 
 
243 aa  359  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  64.44 
 
 
246 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  63.6 
 
 
247 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  63.6 
 
 
247 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  63.6 
 
 
247 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  63.6 
 
 
247 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  63.6 
 
 
247 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  62.76 
 
 
247 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  64.71 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  64.29 
 
 
245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  62.76 
 
 
246 aa  318  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  62.34 
 
 
247 aa  318  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  61.41 
 
 
241 aa  310  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  61.67 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  59.58 
 
 
261 aa  308  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  61.67 
 
 
247 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  61.76 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  59.58 
 
 
247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  59.41 
 
 
267 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  59.41 
 
 
267 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  59.41 
 
 
267 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  59.17 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  57.56 
 
 
244 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  58.7 
 
 
244 aa  288  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  58.2 
 
 
244 aa  285  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  56.72 
 
 
242 aa  281  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  55.37 
 
 
251 aa  280  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  58.16 
 
 
270 aa  279  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  55.65 
 
 
267 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  53.56 
 
 
243 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  52.67 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  53.97 
 
 
245 aa  272  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  53.66 
 
 
247 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  52.44 
 
 
247 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  53.25 
 
 
247 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  53.25 
 
 
247 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  53.25 
 
 
247 aa  269  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  53.53 
 
 
246 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  53.94 
 
 
268 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  52.03 
 
 
247 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  51.63 
 
 
247 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  52.28 
 
 
252 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  50.81 
 
 
247 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  51.05 
 
 
270 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  53.1 
 
 
250 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  40.91 
 
 
245 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  43.43 
 
 
262 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  43.87 
 
 
274 aa  208  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  43.03 
 
 
262 aa  208  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  45.96 
 
 
258 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  38.68 
 
 
288 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  38.68 
 
 
249 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  37.39 
 
 
235 aa  158  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  33.47 
 
 
260 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  36 
 
 
234 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  34.22 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  35.11 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  34.73 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  34.31 
 
 
235 aa  144  9e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  35.15 
 
 
235 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.89 
 
 
234 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  34.73 
 
 
234 aa  142  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  35.56 
 
 
234 aa  142  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  34.51 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  34.53 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  26.46 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  23.38 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  27.18 
 
 
1274 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.31 
 
 
248 aa  52.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  21.69 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
191 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  25.78 
 
 
223 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>