125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4744 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  96.75 
 
 
246 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  80 
 
 
247 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  80.74 
 
 
247 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  79.18 
 
 
247 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  76.73 
 
 
247 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  77.96 
 
 
247 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  78.93 
 
 
247 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  77.29 
 
 
268 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  77.55 
 
 
247 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  76.33 
 
 
247 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  56.02 
 
 
246 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  54.51 
 
 
245 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  54.1 
 
 
245 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  55.33 
 
 
243 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  53.06 
 
 
242 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  54.29 
 
 
247 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  53.5 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  53.5 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  53.5 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  53.11 
 
 
247 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  54.36 
 
 
247 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  53.47 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  53.47 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  53.47 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  53.47 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  53.88 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  53.47 
 
 
247 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  53.47 
 
 
247 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  52.65 
 
 
247 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  52.65 
 
 
247 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  52.65 
 
 
247 aa  268  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  52.65 
 
 
247 aa  268  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  52.65 
 
 
247 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  52.65 
 
 
247 aa  268  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  52.65 
 
 
247 aa  268  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  52.65 
 
 
247 aa  268  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  51.43 
 
 
243 aa  268  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  55.14 
 
 
244 aa  267  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  52.05 
 
 
243 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  52.7 
 
 
261 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  52.24 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  52.05 
 
 
243 aa  265  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  50.2 
 
 
242 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  52.87 
 
 
243 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  50.98 
 
 
252 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  54.44 
 
 
270 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  52.28 
 
 
243 aa  262  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  52.28 
 
 
243 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  52.28 
 
 
243 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  52.28 
 
 
243 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  52.28 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  50.83 
 
 
241 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  52.28 
 
 
243 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  52.28 
 
 
243 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  51.84 
 
 
244 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  51.23 
 
 
243 aa  257  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  48.98 
 
 
244 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  53.72 
 
 
250 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  49.18 
 
 
244 aa  251  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  49.39 
 
 
243 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  50.61 
 
 
267 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  49.8 
 
 
245 aa  248  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  48.96 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  49.39 
 
 
243 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  48.13 
 
 
251 aa  229  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  46.37 
 
 
270 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  41.41 
 
 
274 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  42.34 
 
 
245 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  42.91 
 
 
258 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  41.73 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  41.73 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  38.25 
 
 
288 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  37.5 
 
 
234 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  37.34 
 
 
249 aa  148  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  35.54 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  35.6 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  36.48 
 
 
235 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  36.1 
 
 
234 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  35.39 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  34.71 
 
 
235 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.51 
 
 
234 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  34.85 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  34.85 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  34.85 
 
 
234 aa  129  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  30.99 
 
 
234 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  26.67 
 
 
228 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 
242 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  26.9 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.56 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.71 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  32.85 
 
 
2112 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
246 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.86 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>