270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1389 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  100 
 
 		 2112 aa  4341    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  38.01 
 
 		 1498 aa  746    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  38.76 
 
 		 1176 aa  377  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  37.37 
 
 		 855 aa  350  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  37.37 
 
 		 855 aa  350  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  37.37 
 
 		 854 aa  350  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  40.05 
 
 		 706 aa  323  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  33.28 
 
 		 685 aa  282  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  33.1 
 
 		 694 aa  274  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09020  glycosyltransferase  38.87 
 
 		 507 aa  270  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  33.08 
 
 		 629 aa  258  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  34.65 
 
 		 641 aa  250  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1475  putative AcbV  27.62 
 
 		 381 aa  139  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000178671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  28.47 
 
 		 671 aa  91.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 380 aa  75.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 263 aa  70.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0575  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.26 
 
 		 245 aa  67.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 		 243 aa  63.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.3 
 
 		 276 aa  63.9  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 		 234 aa  63.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 265 aa  63.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 194 aa  63.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 246 aa  63.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  32.39 
 
 		 237 aa  63.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.3 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.91 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 		 230 aa  62.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 404 aa  62.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 		 230 aa  61.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 		 237 aa  62  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.11 
 
 		 247 aa  61.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 		 237 aa  62  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  22.93 
 
 		 471 aa  61.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 246 aa  61.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 		 238 aa  61.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  21.65 
 
 		 369 aa  61.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  31.78 
 
 		 249 aa  61.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.82 
 
 		 247 aa  60.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.71 
 
 		 262 aa  60.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 539 aa  60.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.77 
 
 		 229 aa  59.7  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 		 235 aa  59.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 235 aa  59.7  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.19 
 
 		 235 aa  59.7  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 		 247 aa  59.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  28.67 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.2 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1085 aa  58.9  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 375 aa  58.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 391 aa  58.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.25 
 
 		 240 aa  58.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.63 
 
 		 257 aa  58.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 239 aa  58.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 371 aa  58.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 		 238 aa  57.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 232 aa  58.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  31.43 
 
 		 398 aa  57.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.58 
 
 		 261 aa  58.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 371 aa  57.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 254 aa  58.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 380 aa  57.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.24 
 
 		 249 aa  57.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  24.83 
 
 		 229 aa  57.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 242 aa  57  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 416 aa  57.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  33.04 
 
 		 208 aa  57  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 378 aa  57  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 373 aa  57  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 404 aa  57  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 369 aa  57  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 440 aa  57  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  36.08 
 
 		 298 aa  57  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 399 aa  57  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.86 
 
 		 256 aa  56.6  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.93 
 
 		 229 aa  56.6  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 257 aa  56.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 232 aa  56.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 232 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 232 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 1340 aa  56.2  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 428 aa  56.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 247 aa  56.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  35.96 
 
 		 310 aa  55.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  24.14 
 
 		 229 aa  55.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  24.14 
 
 		 229 aa  55.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  24.14 
 
 		 229 aa  55.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  24.14 
 
 		 229 aa  55.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 398 aa  55.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.19 
 
 		 253 aa  55.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  24.14 
 
 		 229 aa  55.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.62 
 
 		 232 aa  55.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 244 aa  55.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.88 
 
 		 252 aa  55.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 229 aa  55.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 345 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>