163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2686 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  33.33 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  37.75 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  29.11 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  38.73 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  36.27 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.26 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  24.3 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.54 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  28.28 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  29.02 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39660  hypothetical protein  36.43 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  29.05 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  28.39 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  30.13 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  28.39 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  27.1 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  29.46 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  22.43 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  27.67 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.17 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  30.38 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_341  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase  27.56 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  25.97 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  28.35 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.31 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.67 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.29 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.55 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  26.45 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  26.62 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  26 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  23.35 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  27.7 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.53 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  36.71 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  28.17 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  25.64 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  28.93 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  29.09 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.97 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.19 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  25.32 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>