More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1384 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  33.96 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.32 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.38 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  25.54 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.66 
 
 
351 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  28.57 
 
 
351 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  31.34 
 
 
353 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  30.6 
 
 
353 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  26.77 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  27.82 
 
 
351 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_341  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase  27.56 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  28.91 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.5 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.58 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  30.43 
 
 
363 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.52 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  23.98 
 
 
351 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
363 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  35.34 
 
 
357 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.17 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  32.17 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  24.36 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.03 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  33.63 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
362 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.04 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_342  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase, methyltransferase type 12  32.69 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0343727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
365 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  27.12 
 
 
363 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
411 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.6 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  28.26 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0399  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  32.04 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.38 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.54 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
194 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  28.57 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.86 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  31.15 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  23.97 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  28.83 
 
 
351 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  30.91 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1785  O-methyltransferase family protein  27.48 
 
 
196 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.941748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.37 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.91 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.91 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.51 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  22.7 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
337 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6084  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.84 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  33.33 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.75 
 
 
207 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0378  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00156653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  22.86 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8417  O-methyltransferase  29.75 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0381222  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  32.21 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.85 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.04 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0138  O-methyltransferase family protein  28.87 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.744853  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.21 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.21 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.21 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  25.66 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  22.7 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  22.97 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0998  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.33 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7292  predicted protein  33.33 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022094  normal  0.0611989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  23.08 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>