66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0138 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0138  O-methyltransferase family protein  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.744853  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1996  O-methyltransferase family 3  63.54 
 
 
192 aa  255  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.425029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0182  O-methyltransferase family 3  50.55 
 
 
198 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1487  O-methyltransferase family protein  49.18 
 
 
191 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3881  O-methyltransferase family protein  46.29 
 
 
221 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.56879  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5869  transferase  29.19 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
457 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3892  O-methyltransferase family 3  29.32 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3369  cytidine/deoxycytidylate deaminase/NUDIX/methyltransferase domain-containing protein  24.64 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1066  O-methyltransferase family 3  29.66 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3574  O-methyltransferase family 3  26.71 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0883  O-methyltransferase family protein  32.09 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.602304  normal  0.319704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3015  O-methyltransferase family 3  29.2 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1444  O-methyltransferase family protein  28.06 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1768  O-methyltransferase family protein  28.47 
 
 
258 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2380  O-methyltransferase family protein  28.47 
 
 
258 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3834  O-methyltransferase family protein  30.86 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.786829  normal  0.0117824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2155  O-methyltransferase family 3  27.39 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000364971  hitchhiker  0.00389148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11250  predicted O-methyltransferase  25.58 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1209  O-methyltransferase family protein  30.92 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.81955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1856  O-methyltransferase family 3  31.58 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8417  O-methyltransferase  28.06 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0381222  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05830  O-methyltransferase family 3  26.58 
 
 
212 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00143828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2385  O-methyltransferase family protein  27.74 
 
 
258 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2823  O-methyltransferase family 3  26.42 
 
 
227 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
220 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.87 
 
 
247 aa  48.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06420  predicted O-methyltransferase  32.52 
 
 
219 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1182  O-methyltransferase family 3  27.33 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0734  O-methyltransferase family 3  22.34 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4693  O-methyltransferase family 3  27.01 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4338  O-methyltransferase family 3  25.55 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5429  O-methyltransferase family protein  26.35 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6637  O-methyltransferase family protein  25.9 
 
 
238 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635132  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0807  O-methyltransferase family protein  23.77 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0035936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2421  O-methyltransferase family protein  27.27 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2199  O-methyltransferase family protein  27.59 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.826434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4497  O-methyltransferase family protein  27.35 
 
 
252 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.307702  normal  0.378313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0176  O-methyltransferase family 3  25.61 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951952  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4391  O-methyltransferase family 3  22.81 
 
 
228 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000075162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0491  methyltransferase, putative  28.21 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.63 
 
 
307 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0711  O-methyltransferase family protein  30.19 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4009  O-methyltransferase family protein  26.45 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00221471  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4674  O-methyltransferase family protein  23.72 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3995  O-methyltransferase family protein  31.52 
 
 
239 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3051  O-methyltransferase family 3  24.75 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2796  O-methyltransferase family protein  27.27 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3689  O-methyltransferase family protein  23.72 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4069  O-methyltransferase family protein  31.52 
 
 
239 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50174  predicted protein  35.14 
 
 
906 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
224 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  29.63 
 
 
298 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2512  O-methyltransferase family 3  27.34 
 
 
220 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0739211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2922  O-methyltransferase family 3  42.55 
 
 
210 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6795  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  29.13 
 
 
390 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.794475  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5032  O-methyltransferase family protein  23.72 
 
 
222 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404122  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2516  O-methyltransferase family 3  25 
 
 
210 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1123  O-methyltransferase family protein  26.83 
 
 
233 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0443703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1754  O-methyltransferase family protein  28.46 
 
 
222 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10188  O-methyltransferase  22.83 
 
 
218 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.153182  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1473  O-methyltransferase family 3  25.62 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0273584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0191  hypothetical protein  30.39 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.644912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0314  O-methyltransferase family protein  28.46 
 
 
222 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0301267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.37 
 
 
253 aa  41.2  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  24.79 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>