More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5813 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  47.92 
 
 		 314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  47.15 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  40.49 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  44.78 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  33.47 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  36.58 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.58 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.57 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  29.02 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  35.29 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  32.08 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  34.93 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  37.74 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.78 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.77 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  27.52 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30.16 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  35.58 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.52 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  36.19 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  36.84 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  34.26 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  38.24 
 
 		 414 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  32.23 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.64 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  29.75 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  36.19 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  34.58 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.37 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.62 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.37 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.25 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.86 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  33.64 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.11 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  30.57 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.48 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  26.72 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  31.73 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.64 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.17 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.06 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  29.81 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  35.58 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.82 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.06 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 211 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.71 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>