266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1967 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  53.82 
 
 
259 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  41.55 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  40.22 
 
 
295 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.15 
 
 
305 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  32.57 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  27.1 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.05 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.69 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.69 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.89 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.8 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  34.21 
 
 
474 aa  59.3  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.94 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.47 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.94 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.8 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.71 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.71 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  36.45 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
348 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
339 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  34.33 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.29 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30.2 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  35.78 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.14 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  29.25 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.84 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  32.23 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  29.3 
 
 
235 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.27 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.64 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.06 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.08 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  35.34 
 
 
266 aa  52  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.5 
 
 
256 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  34.58 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.97 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 
305 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.66 
 
 
335 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
219 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
327 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.64 
 
 
258 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  23.02 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  26.07 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.34 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.58 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  32.74 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  31.75 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.71 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.99 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.17 
 
 
202 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.71 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
360 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.71 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.15 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.78 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.41 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
274 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.08 
 
 
294 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
204 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
342 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
219 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  32.84 
 
 
206 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.01 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
366 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  25.27 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.69 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  27.21 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.99 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.19 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.78 
 
 
256 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>