247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0507 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 259 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  52.92 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  44.78 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 314 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  43.41 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  35.05 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.95 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.44 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.57 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  32.6 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  39.47 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.57 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  34.16 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  35.45 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  31.52 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  38.05 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  38.6 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  31.52 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.89 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.31 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  29.06 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.67 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.67 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.67 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5922  beta-ketoacyl synthase  35.65 
 
 		 2021 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  32.67 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08412  hybrid PKS-NRPS (Eurofung)  26.52 
 
 		 3930 aa  52.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.24 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.67 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  39.32 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  26.62 
 
 		 631 aa  52.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.03 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.27 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.42 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  29.13 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1457  O-methyltransferase family protein  30.73 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  29.71 
 
 		 347 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.63 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  39.81 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.44 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.27 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.68 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  26.26 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.31 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 353 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  37.14 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  25 
 
 		 396 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.6 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  36.28 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.04 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.17 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.73 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.81 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.81 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.73 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  34.86 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.73 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.96 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  34.38 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.96 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.96 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1690  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.93 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  23.7 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  33.93 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  31.3 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  31.63 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>