217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2578 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  100 
 
 
287 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  47.57 
 
 
308 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  47.39 
 
 
323 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  40 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.59 
 
 
290 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  38.77 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  35.19 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  35.23 
 
 
279 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
258 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  35.4 
 
 
295 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.86 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  33.5 
 
 
274 aa  72  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  34.58 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  28 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.55 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  34.74 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  30 
 
 
357 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.93 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.62 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  29.37 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 
361 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  30.47 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.7 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  32.11 
 
 
280 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  26.59 
 
 
203 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.16 
 
 
258 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  24.03 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
264 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.88 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  25 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  26.98 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  25 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  29.06 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  28.79 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.19 
 
 
395 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  30.19 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  28.44 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  23.68 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.05 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  33.68 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  40.68 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 
223 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.48 
 
 
239 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
625 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
250 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
350 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
305 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  31.13 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.03 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.36 
 
 
420 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  29.7 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  30.19 
 
 
630 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  28.91 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  29.41 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
239 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.53 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
244 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  32.46 
 
 
242 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  25 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
219 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  30.25 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
284 aa  45.8  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  26.97 
 
 
241 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>