73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0931 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 297 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  51.7 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  42.66 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  42.21 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  41.02 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  35.49 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.63 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 		 238 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.65 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 399 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.82 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.33 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  33.8 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.14 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.85 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.05 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.51 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1821  Methyltransferase type 12  30.15 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  23.58 
 
 		 400 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.8 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  32.17 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  33.8 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  31.3 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  26.3 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  33.1 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  23.58 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  32.39 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.06 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  25.86 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  30.23 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.8 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  27.83 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.95 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  27.86 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.11 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.12 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 327 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  23.13 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.73 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  30.17 
 
 		 199 aa  42.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.17 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>